Josh Neufeld, en tant qu’écologiste, caractérise les communautés microbiennes dans les habitats terrestres, aquatiques et associés à l’hôte. En développant et en combinant des techniques moléculaires et dépendantes de la culture, son laboratoire explore les « microbes qui comptent » afin de faire le lien entre ces nouveaux micro-organismes et les rôles importants qu’ils jouent au sein de leurs communautés. Sa passion pour la microbiologie et sa communication l’ont amené à rédiger un manuel de microbiologie, à recevoir de nombreuses récompenses pour son enseignement et à être rédacteur en chef de la revue scientifique ISME.